工业在国民经济中占据主导地位，已初步形成了以食品、机电、轻纺、建材、能源、化工为主体的工业体系，组建了一批工业企业集团，发展屯河、特变电工两家上市公司， 24家上市公司云集昌吉，新加坡丰益集团、香港明基、中粮集团、中国华电、天津物资集团等一批世界500强及国内外知名大企业落地发展，特变与德国西门子、美国杜邦、荷兰壳牌等6家世界500强企业结成战略合作伙伴关系，米泉永昌复合与日本积水公司成功合作。

    并形成了新特变压器、新天葡萄酒、屯河番茄制品、麦趣尔系列食品、西域牌种籽、天山牌面粉等一批名牌产品。“新特”牌荣获中国驰名商标，新特牌电线电缆、新特牌110kV及以下油浸式变压器、天山牌面粉、新天牌葡萄酒、麦趣尔液体奶跻身中国名牌产品。截至目前，全州有10个国家免检产品，20个新疆名牌产品， 5个产品跻身“中国名牌”行列，占全疆总数的62.5%。有11家企业获得自治区质量管理先进企业称号，名牌产品数和企业数均居全疆之首。2005年完成工业增加值82.2亿元，同比增长18.5%。